工资到5000元的时候要扣除个税 。基本工资超过5000元，要交个人所得税，应纳个人所得税税额等于应纳税所得额乘适用税率减速算扣除数 。应纳税所得额等于扣除三险一金后月收入减扣除标准 。
【法律依据】
【工资到多少的时候要扣除个税】根据《个人所得税法》第十一条，居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款 。
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