第一，很明显的可以向量化和矩阵化的loop ， 改变矩阵或者向量的大小，都是比较耗时的 ， 这些可以在R内部通过矩阵化 ， 正确估计矩阵的dim来解决 。
第二，对于比较简单的函数，基本程序本身写好之后，用Rprof做profiling，找到最耗时间的环节，用inline和Rcpp包把最耗时间的部分重新写一次 。
【如何编写高效的R语言程序】第三，可以并行的计算做并行处理 。
第四，使用ff包处理大的数据表格 。
第五，用sparse matrix处理大矩阵 。
第六 ， 使用正确的算法也很重
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